top of page

Chr1-6

"Chromsome City"

Overview

Number of Genes

354

Size of Pattern

30,473,888 nt

hg38 Coordinates

chr1:119414077-149887965

List of Genes in Pattern

LOC109029530   HSD3B2   GAPDHP74   HSD3BP2   GAPDHP23   HSD3BP1   LOC105378935   GAPDHP58   LOC109029529   HSD3B1   GAPDHP32   HSD3BP3   GAPDHP27   HSD3BP4   GAPDHP33   LINC00622   HSD3BP5   ZNF697   LOC105378937   PHGDH   LOC105378936   HMGCS2   REG4   LOC105378938   NBPF7P   PFN1P9   NOTCH2P1   ADAM30   NOTCH2   LOC111776218   LOC120807608   LOC101929178   LOC105378939   LOC105378940   RNU6-465P   SEC22B   LOC100996723   LOC107985522   LOC105378941   LOC105378954   LOC101929788   NBPF8   LOC107985523   PFN1P2   PDE4DIPP2   LOC107985524   LOC105378944   LOC105378943   NOTCH2NLR   NBPF26   TRN-GTT7-1   RNVU1-19   PPIAL4A   LINC00623   LOC100996720   RNVU1-4   TRN-GTT11-1   LOC107985106   LOC105369199   FAM91A4P   PDE4DIPP4   TRF-GAA10-1   TRG-CCC6-1   TRV-CAC5-1   TRN-GTT27-1   LOC100996722   H3P4   FCGR1B   LOC100996318   H2BP1   RPL22P6   FAM72B   LOC112577489   SRGAP2C   LOC107985193   SRGAP2-AS1   LOC107985107   LINC02798   MTIF2P1   EMBP1   LINC01691   LOC101929814   LOC105371172   LOC105371175   LOC100996736   LOC107985200   LOC107985201   RNA5SP533   LOC101929815   NKAIN1P1   LOC101927452   LINC02799   LOC112268273   TRQ-CTG11-1   NBPF17P   PFN1P12   RNU1-114P   TRE-TTC7-1   TRQ-CTG4-2   RNVU1-17   TRN-GTT22-1   RNVU1-23   RNVU1-18   TRN-GTT6-1   LOC105369140   FAM91A3P   RNU1-143P   LINC02591   TRF-GAA9-1   TRV-CAC8-1   TRV-CAC4-1   PDE4DIPP3   TRN-GTT12-1   LOC100131962   H2BP2   TRR-CCT7-1   FCGR1CP   H3-2   LOC105371209   RPL22P5   FAM72C   SRGAP2D   IGKV1OR1-1   LOC105371207   LOC105371206   LOC100996731   LINC02802   RNA5SP529   LOC101060524   CH17-125A10.2   LOC105371196   PPIAL4E   LOC105373467   RNVU1-15   LOC113939979   LOC101060207   TRN-GTT3-1   NBPF15   PFN1P6   LOC105371211   RNVU1-2A   LOC105379574   LOC107985110   TRN-GTT2-8   PPIAL4F   LINC01632   LOC105371214   LOC105371215   LOC101927429   DRD5P2   RNA5SP59   LSP1P5   LOC100996737   LOC105371216   LOC105371217   LOC102724269   LOC107985528   SRGAP2B   LOC107985595   FAM72D   LOC105371219   LOC120893158   TRN-GTT10-1   LOC101929805   TRNAV-CAC   LINC01145   RNU1-153P   TRE-TTC10-1   LOC100996740   LOC729086   PPIAL4D   RNVU1-14   LOC101060170   TRN-GTT2-7   NBPF20   LOC105371312   PFN1P3   RNU1-154P   LOC105371288   TRQ-CTG3-1   LOC112268228   TRN-GTT9-1   PDE4DIPP5   NBPF25P   GPR89A   PDZK1   CD160   RNF115   POLR3C   NUDT17   PIAS3   MIR6736   ANKRD35   LOC107985593   ITGA10   PEX11B   GNRHR2   RBM8A   LIX1L-AS1   LIX1L   POLR3GL   ANKRD34A   LOC106783502   LOC108254679   TXNIP   HJV   TRE-CTC1-1   TRG-TCC2-1   TRH-GTG1-1   TRK-CTT2-1   LOC107985594   RNVU1-6   LINC01719   NBPF10   NOTCH2NLA   LOC105371254   RNU6-1071P   NUDT4P2   SEC22B4P   PPIAL4H   TRN-GTT24-1   LOC112268274   LOC100996756   LOC105371235   LOC105371233   LOC107985591   HYDIN2   RNA5SP536   NBPF12   PFN1P8   LOC728989   LOC644060   LOC105371231   TRH-GTG1-2   TRE-TTC14-1   RNU1-151P   SSBL4P   RNVU1-8   NBPF13P   PRKAB2   CHD1L   PDIA3P1   FMO5   CCT8P1   RPL7AP15   LOC111556113   LOC100130018   LINC00624   OR13Z1P   OR13Z2P   OR13Z3P   BCL9   ACP6   RN7SL261P   LOC102723321   LOC105371230   LOC110121261   GJA5   LOC391092   GJA8   LOC105371229   GPR89B   PDZK1P1   LINC02804   TRR-CCT6-2   RNU1-129P   TRQ-CTG3-2   RNVU1-7   TRN-GTT9-2   PDE4DIPP1   NBPF11   PFN1P4   ABHD17AP1   LOC105371227   LINC02805   RNA5SP57   LOC101927468   RNVU1-22   LOC112577490   TRQ-CTG4-1   LINC01731   LINC02806   TRH-GTG1-3   LOC105371225   TRH-GTG1-4   TRE-TTC6-1   TRQ-CTG7-1   MIR5087   RNVU1-21   TRQ-CTG9-1   RNVU1-1   TRN-GTT23-1   RNU1-155P   MIR6077   RNVU1-2   PDE4DIPP6   RNVU1-3   LINC01138   LOC647481   LOC105371224   PPIAL4G   TRN-GTT2-1   NBPF14   NOTCH2NLB   LOC105371223   LOC105371222   RNU6-1171P   NUDT4B   SEC22B3P   PDE4DIP   RN7SKP88   LOC112268272   RNU2-38P   NBPF9   LOC102724437   LOC101929790   LOC102723348   RNVU1-24   LOC730257   LOC653513   SEC22B2P   LOC105371403   NOTCH2NLC   NBPF19   LOC101060227   TRN-GTT25-1   PPIAL4C   LINC00869   TRN-GTT11-2   FAM91A2P   RNU1-68P   LOC112268236   LOC644634   LOC100189498   TRV-CAC1-7   PDE4DIPP7   LOC105371406   TRN-GTT8-1   LOC100129586   TRR-CCT8-1   H2BC18   FCGR1A   H3C13   H4C14   H3C14   H2AC18   H2BC19P   H2BC20P   H2AC19   H3C15   H4C15   H2BC21   H2AC20   H2AC21

2k nt Resolution Heatmap:

Visit CSYNTH and drag the downloaded CONTACTS file into the browser to play with the model!

© 2025 Marcet-Palacios

bottom of page