top of page

Chr17-1

Overview

Number of Genes

250

Size of Pattern

6,785,630 nt

hg38 Coordinates

chr 17:15436015-22221645

List of Genes in Pattern

CDRT4   TVP23C-CDRT4   RPL9P2   CDRT3   LOC112529896   TVP23C   PPIAP53   CDRT1   LOC105943587   TRIM16   ZNF29P   ZNF286A   ZNF286A-TBC1D26   UBE2SP1   TBC1D26   TBC1D26-AS1   CDRT15P2   ZSWIM5P1   RNA5SP436   IL6STP1   MEIS3P1   LINC02087   SPECC1P1   LOC106020711   ADORA2B   ZSWIM7   TTC19   NCOR1   RPLP1P11   RPL22P21   RNU6-314P   RNU6-862P   SNORD163   RN7SL442P   PIGL   MIR1288   LOC112529897   CENPV   UBB   FTLP12   LOC116276455   TRPV2   SNHG29   SNORD49B   SNORD49A   SNORD65   LRRC75A   ZNF287   SRSF6P2   ZNF624   NEK4P2   CCDC144A   RNASEH1P2   RNU6-405P   RN7SL620P   UPF3AP1   USP32P1   SRP68P1   FAM106C   LOC108745275   NOS2P4   KRT16P6   KRT16P2   KRT17P1   LOC106020709   KRT17P4   COTL1P1   TBC1D27P   TNFRSF13B   LOC284191   LINC02090   MPRIP   LOC113939958   RNU6-767P   RN7SL775P   PLD6   FLCN   ACTG1P24   COPS3   NT5M   LOC112529898   RPL13P12   LOC111556156   TSEN15P1   MED9   RASD1   PEMT   LOC110121461   RNU6-468P   EEF1A1P43   SMCR2   RAI1   LOC112529899   RAI1-AS1   SMCR5   SREBF1   MIR6777   MIR33B   TOM1L2   DRC3   LOC107984989   BRI3P3   ATPAF2   GID4   DRG2   MYO15A   ALKBH5   LLGL1   FLII   MIEF2   TOP3A   RPL7AP65   RPL21P121   SMCR8   SHMT1   MIR6778   EVPLL   TBC1D3P4   LINC02076   YWHAEP2   KRT17P5   KRT17P2   KRT16P1   KRT16P4   TNPO1P2   LGALS9C   NOS2P2   USP32P2   FAM106A   SRP68P2   CCDC144B   RPS28P9   LOC107985051   TBC1D28   ZNF286B   FOXO3B   UBE2SP2   TRIM16L   FBXW10   LOC112529900   TVP23B   LOC101929141   RN7SL627P   PRPSAP2   SLC5A10   FAM83G   GRAP   LOC112268188   SNORD3B-1   SNORD3B-2   KYNUP2   SNORD3D   GRAPL   GRAPL-AS1   KYNUP1   SNORD3A   SNORD3C   KYNUP3   LOC388436   EPN2   EPN2-IT1   EPN2-AS1   B9D1   MIR1180   MAPK7   MFAP4   RNF112   LOC105371574   LINC02094   RPS2P46   LOC112268205   RPL17P43   TRW-CCA2-1   SLC47A1   SNORA59B   LOC105371578   SLC47A1P1   MTND1P14   NMTRQ-TTG12-1   MTND2P12   MTCO1P39   SLC47A1P2   ALDH3A2   SLC47A2   ALDH3A1   ULK2   NDUFB4P3   TRG-CCC3-1   AKAP10   SPECC1   LOC100131943   LOC105371579   KCTD9P1   RNU6-258P   RNU6-1057P   CCDC144CP   RNU6-467P   UPF3AP2   USP32P3   SRP68P3   FAM106B   NOS2P3   LOC108745276   LGALS9B   TNPO1P3   YWHAEP3   KRT16P5   KRT16P3   KRT17P6   LOC106020710   KRT17P7   TBC1D3P3   COTL1P2   LOC105371580   CDRT15L2   ZSWIM5P2   MEIS3P2   LINC02088   LOC105371583   LOC106020712   LOC100287072   RNFT1P3   HNRNPA1P19   OLA1P2   SCDP1   ABHD17AP6   CCDC144NL   CCDC144NL-AS1   RNU6-1178P   RNASEH1P1   LOC339260   SPECC1P2   USP22   LINC01563   DHRS7B   TMEM11   LOC107984969   RN7SL426P   NATD1   EIF1P5   MAP2K3   KCNJ12   PDLIM1P2   LOC105371589   RPL21P120   LINC02693   KCNJ18   NCOR1P2   UBBP4   FTLP13

2k nt Resolution Heatmap:

Visit CSYNTH and drag the downloaded CONTACTS file into the browser to play with the model!

© 2025 Marcet-Palacios

bottom of page