top of page

ChrX-2

Overview

Number of Genes

200

Size of Pattern

4,663,163 nt

hg38 Coordinates

chr X:48107982-52771145

List of Genes in Pattern

SSX6P   SPACA5B   LOC643554   RNU6-707P   SSXP3   S100A11P5   SSX5   LOC100420083   RNA5SP503   S100A11P7   LOC100420084   SSX1   S100A11P6   SSXP8   LOC100420551   LOC791091   SSX9P   LOC791092   SSXP9   S100A11P9   SSX3   LOC791093   LOC101060049   SSX4   SSX4B   LOC791095   SSXP6   SSXP7   LOC791096   SLC38A5   FTSJ1   LOC119407399   LOC101927635   PORCN   EBP   LOC116309152   TBC1D25   LOC119407400   RBM3   MRPL32P1   WDR13   LOC107985695   VN1R110P   WAS   SUV39H1   LOC113875031   RNU6-1056P   LOC119407401   GLOD5   LOC100420869   RNU6-29P   LOC116309153   LOC119407402   LOC119407403   GATA1   LOC119407404   LOC119407405   LOC119407406   LOC119407407   LOC119407408   HDAC6   ERAS   PCSK1N   TIMM17B   PQBP1   SLC35A2   PIM2   OTUD5   LOC119407411   LOC119407412   RNU6-722P   KCND1   GRIPAP1   LOC114022707   LOC119407413   TFE3   LOC113875032   LOC119407414   CCDC120   PRAF2   WDR45   RNU4-52P   GPKOW   LOC105373195   LOC116309154   LOC116309155   RN7SL262P   LOC111365200   MAGIX   LOC119407415   LOC119407416   LOC119407417   PLP2   PRICKLE3   LOC119407418   LOC119407419   LOC119407420   SYP   LOC119407421   SYP-AS1   CACNA1F   HSPB1P2   CCDC22   LOC119407422   FOXP3   FLICR   PPP1R3F   GAGE10   GAGE12J   GAGE13   GAGE12B   GAGE12C   GAGE12D   GAGE12E   GAGE12F   GAGE12G   GAGE12H   GAGE2A   GAGE1   VDAC1P2   SALL1P1   PAGE1   PAGE4   USP27X-DT   USP27X   CPSF1P2   CLCN5   RNU6-421P   MIR532   MIR188   MIR500A   MIR362   MIR501   MIR500B   MIR660   MIR502   PYY3   AKAP4   CCNB3   DGKK   SHROOM4   RNU6-935P   H3P44   BMP15   HMGB1P15   LOC105373202   LOC100420318   LOC101060199   LINC01284   LOC100420331   LOC105373204   NUDT10   LOC100419238   EZHIP   NUDT11   LINC01496   TRE-CTC18-1   CENPVL3   LOC105373205   CENPVL2   CENPVL1   GSPT2   MAGED1   LOC100631242   RNU6-504P   IPO7P1   UQCR10P1   TPMTP3   LOC401589   LOC105377208   MAGED4B   SNORA11E   MAGED4   SNORA11D   LOC105377209   LOC100421603   MIR8088   XAGE2   LOC107987327   RBM22P6   XAGE1A   RBM22P7   XAGE1B   RBM22P11   LOC107985640   LOC107985659   SSXP4   SSXP1   LOC100420089   SSX8P   SSX7   LOC791097   RNA5SP504   SSXP5   S100A11P10   SSX2   LOC791098   LOC102723585   SSX2B   S100A11P8

2k nt Resolution Heatmap:

Visit CSYNTH and drag the downloaded CONTACTS file into the browser to play with the model!

© 2025 Marcet-Palacios

bottom of page